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内容导航:1、怎样使用NCBI搜索并下载基因序列2、白蛋白基因工程菌的构建虚拟仿真软件介绍1、怎样使用NCBI搜索并下载基因序列
工具/材料
NCBI官网
操作方法
首先,我们打开NCBI官网页面,在页面上方搜索框中,选择要下载的基因序列类别,这里我们需要选择“Nucleotide”选项。
接下来,我们就需要输入具体的名称了,这里我输入的是Kinase,代表一种酶,然后点击“search”按钮,即可出现搜索结果。
点击进入所需要的搜索结果,在页面中左侧,点击“FASTA”按钮。
在接下来打开的页面右侧,点击“Send to”选项,然后选择“File”,点击“Creat File”按钮。
最后,我们即可调用浏览器下载该基因序列文件了,选择好文件存储位置之后,点击“下载”按钮。
2、白蛋白基因工程菌的构建虚拟仿真软件介绍
什么是血清白蛋白?人血清白蛋白(HSA)是人体血浆中最丰富的蛋白质,含量占血清总蛋白的60%,约为35--40g/L,主要功能为维持血浆渗透压以及各类物质的转运。HSA广泛应用于休克及烧伤治疗、术后恢复、药物载体、细胞培养基等,其全世界需求量已达600吨/年左右,中国需求量约占其三分之一。
那么问题来了,为什么要构建血清白蛋白基因工程菌呢?
传统的血清白蛋白的提取主要来自人血,相应的纯化工艺为低温乙醇沉淀法,其来源严重受到血液供给的限制,存在血液病毒传播和扩散风险,且纯化过程中对大量有机试剂和低温控制的需求也导致其效率低下。
利用转基因技术构建工程菌并生产外源蛋白最早起源于上世纪70年代,为珍贵的蛋白类药物以及更高效、更环保的工业酶的产业化应用提供了巨大的推动作用。目前,利用转基因技术已在多种表达系统中实现了人血清白蛋白的外源表达及相关纯化工作,包括大肠杆菌、酿酒酵母、毕赤酵母、动植物细胞以及动植物。
怎么才能获得表达人血清白蛋白的基因工程菌呢?这需要一系列复杂且周期长的实验操作,白蛋白基因工程菌的构建虚拟仿真软件将告诉你答案。
这款虚拟大型综合分子实验软件,解决传统实验周期长、预期结果不易得、成本高的问题,具体优点如下:
1、实验场景为高度仿真的3D分子实验室场景,所有实验仪器模型,根据现实设备等比例三维建模模拟,模型包括实验全过程中所用到的设备仪器、试剂、药品,包括高速离心机、超净工作台、振荡培养箱等,且配有标准规范的仪器操作步骤。
2、按照实际实验工作量大小及相关性,软件分为8个小模块,循序渐进、合理安排学习时间。
3、“引物的设计及合成”模块设有工作站,可对“引物的设计”全过程进行学习,包括通过NCBI对目的基因序列进行查找以及软件BioXM、primer5的使用。
4、评分功能:本软件考核分为步骤得分和数值得分,步骤及仪器操作正确、需要试剂量的数值输入正确可获得相应得分,以提高学生实际实验的规范性,加深各试剂用量的记忆。
5. 两种模式:练习模式与考核模式,练习模式可对整个实验进行反复多次练习,以提高操作熟练度、降低实际实验的失误率,节省耗材;考核模式隐藏所有提示,根据情况给出评分;
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