任天堂3DS游戏机的编程语言主要是C++和Lua。C++是一种高级编程语言，它可以用于开发各种类型的应用程序，包括游戏。C++具有高效、可移植、可扩展等特点，因此被广泛应用于游戏开发领域。在3DS游戏机上，C++主要用于开发游戏引擎、物理引擎、图形渲染等核心功能。
另外，3DS游戏机还支持Lua编程语言。Lua是一种轻量级的脚本语言，它具有简单、灵活、易学等特点。在游戏开发中，Lua通常用于编写游戏逻辑、AI、UI等方面的代码。由于Lua的运行速度较快，因此在3DS游戏机上使用Lua编写的代码可以实现较高的性能。
除了C++和Lua之外，3DS游戏机还支持其他编程语言，如Python、Java等。这些编程语言在游戏开发中也有着广泛的应用。例如，Python可以用于编写游戏脚本、工具等；Java可以用于开发Android平台上的游戏。
总之，3DS游戏机的编程语言主要是C++和Lua，这两种语言在游戏开发中都有着重要的作用。同时，3DS游戏机还支持其他编程语言，开发者可以根据自己的需求选择合适的语言进行开发。