本文目录
- 为什么在uniprot中一个ID会对应到PDB数据库中的多个ID
- pdb的数据
- oracle12c怎么创建pdb数据库
- oracle pdb数据库怎么打开
- 如何搜索PDB数据库
- 谁知道VC产生的程序数据库 (PDB) 文件有什么用什么时候用怎么用
为什么在uniprot中一个ID会对应到PDB数据库中的多个ID
PDB 是蛋白质复合物的数据库，一个pdb id 往往代表多个蛋白质形成的复合物，或者蛋白质与小分子形成的复合物。而uniprot是蛋白质数据库，一个id就代表一个蛋白质。考虑到一个蛋白质可能与多个其他蛋白或者小分子组合，因此，不同的pdb中会包含相同的蛋白质，也就是说一个uniprot id会对应多个pdb id
pdb的数据
蛋白质数据库（Protein Data Bank,PDB） 是一个生物大分子(如蛋白质和核酸)数据库, 内容包括由全世界生物学家和生物化学家上传的蛋白质或核酸的X光晶体衍射或者NMR核磁共振结构数据，这些数据可以通过PBD的会员组织（PDBe,PDBj,RCSB）免费获取。PDB是由世界蛋白质数据库（Worldwide Protein Data Bank,wwPDB）管理。PDB是结构生物学的关键性资源，大部分学术刊物，以及一些官方科研机构[如美国的国立卫生研究院（NIH）]，现在都要求科学家将它们研究的蛋白质、核酸结构上传到PDB。 从PDB的网站上，可以通过蛋白质的编号查找到相应的3D结构，并可以将这个结构图下载到电脑中，通过PyMol、RasMol、Chimera、VMD、Swiss-PdbViewer等软件查看、编辑。从PDB网站上下载的3D结构图的后缀名为.pdb。
oracle12c怎么创建pdb数据库
首先你需要确认，建好的数据库是容器容器数据库（CDB）。然后通过类似下面的语句：CREATE PLUGGABLE DATABASE catalog12cADMIN USER catalogadm IDENTIFIED BY catalogadmROLES = (dba)DEFAULT TABLESPACE catalog_tbsDATAFILE ’/u01/oradata/GDBNAME/catalog12c/catalog_tbs01.dbf’ size 1g autoextend on next 100m maxsize unlimitedFILE_NAME_CONVERT = (’/u01/oradata/GDBNAME/pdbseed/’,’/u01/oradata/GDBNAME/catalog12c/’)STORAGE unlimitedPATH_PREFIX = ’/u01/oradata/GDBNAME/catalog12c/’;即可以pdb$seed为；模板创建出pdb。
oracle pdb数据库怎么打开
PDB全称为Pluggable Database，即可插拔数据库。打开PDB数据库的方法有两种：方式1：SQL》 alter pluggable database PDBEPPS open;Pluggable database altered.SQL》 select con_id, dbid, guid, name , open_mode from v$pdbs; CON_ID DBID GUID NAME OPEN_MODE---------- ---------- -------------------------------- ------------------------------ ---------- 2 4071321146 E89E8DA2866E3157E043DE07A8C09238 PDB$SEED READ ONLY 3 1930201447 E89E9418B882350CE043DE07A8C092B6 PDBEPPS READ WRITE 方式2：SQL》 alter session set container=PDBEPPS;Session altered.SQL》 startupPluggable Database opened.
如何搜索PDB数据库
PDB是Palm DataBase的缩写,Palm OS所用文件的扩展名为.pdb。可以使用PalmReader打开。 如果想把PDB文件转换成TXT文件查看，可以使用WavePDB转。 程序数据库 (PDB) 文件保存着调试和项目状态信息，使用这些信息可以对程序的调试配置进行增量链接。常见的VC80.PDB（更笼统地说就是 VCx0.PDB，其中 x 表示 Visual C++ 的版本。） 该文件存储各个 OBJ 文件的所有调试信息并与项目生成文件驻留在同一个目录中。
谁知道VC产生的程序数据库 (PDB) 文件有什么用什么时候用怎么用
使用/Zi选项编译的对象(.obj)文件包含程序数据库(PDB)的名称。不将对象的PDB文件名指定给链接器；如果需要，LINK使用嵌入的名称查找PDB。这同样适用于库中包含的可调试对象；可调试库的PDB必须可用于链接器和该库。LINK还使用PDB保存.exe文件或.dll文件的调试信息。程序的PDB既是输出文件也是输入文件，因为LINK在重新生成程序时更新PDB。