1、秦朝的中央行政机关实行三公九卿制。皇帝之下设三公，三公为：
（1）丞相，承受皇帝之命，辅助皇帝掌管天下的行政的官。
（2）太尉，掌管军事的最高官吏。
（3）御史大夫，主要管理记事，其地位相当于副丞相，主要职责是管理图籍、奏章，监察文武百官。御史大夫下设御史中丞，掌管图书秘籍，同时监察文武官吏。侍御史，掌管文书。监御史，中央派到地方各郡负责监督郡守的御史。
2、三公之下设九卿，作为中央行政机关分掌具体行政事务，如祭祀、礼仪、军事、行政、司法、文化教育等。包括：
（1）奉常，掌管宗庙礼仪，地位很高，属九卿之首。
（2）郎中令，掌管宫殿警卫。
（3）卫尉，掌管宫门警卫。
（4）太仆，掌管宫廷御马和国家马政。
（5）廷尉，掌管司法审判。
（6）典客，掌管外交和民族事务。
（7）宗正，掌管皇族、宗室事务。
（8）治粟内史，掌管租税钱谷和财政收支。
（9）少府，掌管专供皇室需用的山海池泽之税。