1、翡翠和玛瑙的主要区别在于结构不同，翡翠是一种玉石，内部以纤维交织结构为主，通过光线照射可以看到明显的矿物颗粒，而玛瑙属于一种中性矿物，属于隐晶矿物的集合体，内部矿物颗粒看不到。通常情况下，翡翠的原色以绿色为主，其质量也是最好的。
2、表面颜色为片状或丝状。仔细观察，有一些明显的色根，而玛瑙的颜色为红色，颜色层次纹理均匀，没有明显的色根或色带。天然玉石质地通明或许半通明，外表油润光亮，细心调查，可见近圆形略通明的 盐 和周围的纤维状物质。天然玉石是翡翠，摩氏硬度为度，用尖刀雕刻，不会留下痕迹，假玉石硬度低，尖刀雕刻会给人留下痕迹。
3、玛瑙是隐晶质集合体，结构致密，也就是说看不到晶体颗粒，而翡翠有典型的纤维交织结构，放大检查很容易识别。两者在色调上有很大的区别。绿玛瑙在绿色中是有一点蓝色感觉的，其绿色是足够的，而翡翠的绿色，非常纯正，而绿玛瑙都是由人工染色制成的，颜色分布均匀，色泽完美，没有明显的色形，而翡翠的颜色以片状、丝状和不均匀分布的玛瑙有明显的地带性条纹，很容易分辨。