1、四爪陆龟。四爪陆龟，又叫草原龟，以哈萨斯坦南部荒漠地区和天山山前地带为多，印度、巴基斯坦、伊朗也有分布。在中国仅分布于新疆伊犁境内，为国家一级保护动物。四爪陆龟背甲长12-16cm，宽10-14cm。背甲中部略微扁平，看上去其背甲基本上呈圆形。四爪陆龟生活于海拔700-1000m的黄土丘陵草原半荒漠地区，常在在蒿草丰富、土质湿润、螺壳较多的阴坡凹地栖息。
2、新疆北鲵。新疆北鲵，俗名娃娃鱼，又叫水四脚蛇，是新疆唯一存活下来的有尾两栖动物，栖息于新疆温泉县境内，仅生活在海拔2100-3200米的高山泉水小溪、湖泊浅水处，是阿拉套山和天山由地面抬升时幸存下来的动物。分布在中国新疆和哈萨克斯坦两国的阿拉套山和天山的局部泉涌地区。
3、塔里木兔。塔里木兔又名南疆兔、野兔、莎车兔，是塔里木盆地的特有种，也是塔里木古陆块的残存种类。塔里木兔体形较小，毛色较浅，耳朵较大，耳尖不呈黑色是与雪兔最明显的区别；整体毛色与栖息环境非常接近；听觉器官非常发达，耳长达10厘米，超过其他兔类。塔里木兔是典型的荒漠地带物种，栖息在塔里木盆地海拔900~1200米的河流和罗布泊附近，以及沿河两岸的胡杨和红柳林中、盆地中央的塔克拉玛干沙漠四周的半沙漠草原和塔里木河河水泛滥地区等。
4、新疆大头鱼。新疆大头鱼又称为扁吻鱼，是中国的特产鱼类，也是世界裂腹鱼中的珍贵物种。新疆大头鱼 起源于3亿年前，有着古鱼类活化石之称。仅一属一种，在世界上的分布，仅存于塔里木水系，已在原最大产地博斯腾湖绝迹，它在中国濒危野生动物红皮书鱼类部分中，属一级保护动物，新疆大头鱼与陆上大熊猫同属一个级别，有着极高的经济价值和学术价值。
5、吐鲁番沙虎。吐鲁番沙虎属中等体型蜥蜴类，一般成体体长75mm左右，大个体体长可达90mm左右，两性体长差异不明显。皮肤柔软，趾生栉缘适宜沙质环境生活。