1、两者形成的原因不同。棉线是因为翡翠中硬玉物的颗粒空位、裂隙和杂质包裹体构成的，或许是一些极细小的裂隙组成。而石纹是翡翠在地质运动的效果或外力效果下，使翡翠内部产生裂缝，一些外来的物质以热液的方法进入翡翠的裂缝中，外来物质在翡翠裂缝中不断的填充和重结晶，经过上万年乃至更久，裂缝完全愈合，形成了石纹。所以，石纹就像我们身体上慢慢愈合的伤口，它对翡翠的坚固耐用程度机会没有影响，只是可能像伤疤一样有点影响美观。
2、它们的外形不同。石纹的外形看起来像裂缝，但不是裂纹，用指甲刮石纹时能感觉到刮拉指甲的感觉，因为石纹是由裂纹愈合而成的，或是由聚集成的线状、刀片口、片状的棉组成，石纹的条纹是没有开口的，只是石纹部分的翡翠肉质比正常的翡翠肉质疏松一些而已。
3、它们的大小不同。石纹长度一般会比翡翠的棉线要大一些，如果有多条石纹的话，往往石纹都是沿着同一个方向交叉排列的。但是棉线的外形一般为针状，纤维状、云雾之光、团状、片状，而且棉线一般都是相互交结在一起的，比较短细。