1、科属区别：泥鳅和蚯蚓的类别差异是非常大的。具体来看，泥鳅属于脊索动物门硬骨鱼纲鲤形目鳅科泥鳅属，蚯蚓则属于环节动物门寡毛纲单向蚓目正蚓科正蚓属。从比较大的分类来看，泥鳅是脊椎动物，而蚯蚓则是无脊椎动物，是差异非常大的两种动物，这一点从二者门、纲、目以及更具体的分类不同也可以看出来。
2、体型区别：泥鳅和蚯蚓的体型差异很大，二者相比蚯蚓的体型比泥鳅小很多。
3、胡须区别：从外观来看，泥鳅和蚯蚓也有很多明显的差异。比如胡须，泥鳅是有胡须的，蚯蚓则没有。
4、食物区别：从习性来看，二者的差异也比较大，食性就是不同的。泥鳅的食物比较多，其中有小型的动物，比如甲壳动物、水生昆虫等，以及植物类，比如藻类植物和植物碎屑。不过蚯蚓的食物则是土壤中的有机废物，可以起到松土的作用。