1、容器材质，蜂蜜带有弱酸性，与金属接触时，容易引起氧化反应，析出铁、铅、锌等金属离子，使蜂蜜变色呈黑色，其营养价值也会遭到破坏。有的人吃了这种蜂蜜会出现恶心、呕吐等中毒症状。因此，保存蜂蜜不能用金属容器，应采用非金属容器，如陶瓷、玻璃瓶、无毒塑料桶等容器来贮存蜂蜜。
2、密封保存，一般家里吃的蜂蜜都是灌装，吃一点就倒出来一点，然后盖上盖子封存，这种盖子并没有什么有效的密封措施，空气和细菌都容易进入。所以在选择蜂蜜的时候，可以选择小罐装的，几天就能吃完。如果不幸买的是大罐装，买一卷保鲜膜，每次吃完先盖上盖子，然后用保鲜膜裹住瓶口即可。
3、和异味食物分开，蜂蜜在贮存过程中还应防止串味、及湿、发酵、污染等。为了避免串味和污染，不得与有异味物品(如汽油、酒精、大蒜等)腐蚀性的物品(如化肥、农药、石灰、碱、硝等)或不卫生的物品(如废品、畜产品等同储存)。
4、储存环境，蜂蜜保存宜放在低温避光处。其实蜂蜜不一定放冰箱里保存，常温阴凉避光就行。蜂蜜中的葡萄糖和果糖，可以吸收空气中的水分，结果变的稀薄，容易发酵变质。因此，蜂蜜要放在干燥处，并加盖保存。另外，蜂蜜中含有多种酶和维生素，酶和维生素见光会分解，因此最好避光保存。
5、冷水保存，还有一个保存方法就是冷水保存，用袋子将瓶装的蜂蜜装起来，封口要严实，不能漏水。再用一个大小合适的水盆盛满水放到阴凉的地方，然后将蜂蜜放入其中。如果你家在农村，有水井的话，可以将蜂蜜放到井里，保存效果很多，蜂蜜不会结晶。农村养牛场都是用这个方法来保存鲜牛奶的。