祁门红茶的制作工艺特别精细，分为初制和精制两大工序。初级体系奠定品质的基础，精制体系将相对粗糙的粗茶升华为富有精神和美感的上品。有四道初级工序，十几道精炼工序，近十个等级，几十种颜色，极其复杂精美。每一个动作都是孜孜不倦的重复和呕心沥血，是其他功夫红茶无法比拟的。所以祁门红茶又叫“祁门功夫红茶”，也是中国功夫红茶的代表。
首先，采摘
祁门红茶在春夏两季采摘，最佳时间为4月5 ~ 15日，即清明节后、谷雨前。此时茶树的第一片芽叶刚刚在春天发芽，此时的芽头是最新鲜、最美的。
以前用祁门红茶加工功夫茶时，采摘标准主要是一芽二叶三叶。近几年开始做红毛峰、红蜗牛等香型红茶，采摘越来越嫩。早春，越来越多的茶叶是一芽一叶甚至单芽采摘。
第二，萎靡不振
采摘鲜叶后的第一步，会开始枯萎，即把采摘下来的鲜叶摊开晾干，使叶子中的水分均匀流失，叶子枯萎死亡。
第三，滚动
鲜叶萎凋后，就要开始茶叶成型的第一步，揉捻。
一般来说，揉面就是像揉面一样把枯叶揉成条状的过程。在揉捻过程中，重要的是打破茶叶中的细胞，使茶叶中的茶多酚与空气中的氧气接触，进行酶促氧化，为下一步发酵奠定基础，有利于红茶香气的形成。
第四，发酵
如果说揉捻是祁红品质的基础，那么发酵就是祁红品质的关键。
发酵是制作红茶的关键步骤，也是红茶变红的决定性过程。揉捻的茶叶经过发酵后，绿茶的茶叶才会逐渐变红，形成红茶特有的色、香、味。
5.烘干。
最后的准备过程是干燥。通过高温烘焙，一方面终止酶活性，防止过度发酵；其次，将茶叶中的水分烘干到7%以下，有利于茶叶的保存；三是丰富和发展香气。
高温干燥时，散发出带有青草味的低沸芳香物质。同时，糖类和氨基酸与糖类反应产生蜂蜜香气物质，大量具有果香和花香的香气物质，如内酯、萜类、醇类等，形成祁门红茶的香气特征。