pda医学上是什么意思，pda是什么（癌症、微生物药物、脑肠轴、皮肤-肠道轴、共生病毒、阴道微生物、菌群免疫互作、肠道黏液、粪菌移植）

11 Cell Host & Microbe：人类肠道细菌对食品加工过程中有害产物的生物修复作用

研究名称：Bioremediation of a Common Product of Food Processing by a Human Gut Bacterium

期刊：Cell Host & Microbe

发表时间：2019年10月9日

IF：15.753

DOI: 10.1016/j.chom.2019.09.001

加工食品消费的急剧增长构成了全球健康威胁。加工食品中常见的美拉德反应产物（MRPs）是由氨基酸与还原糖的热诱导反应生成的，包括对健康有害的晚期糖基化终产物，这些化学物质与与糖尿病和心脏病相关的炎症有关。

近日，发表在《Cell Host & Microbe》上的一篇研究报道发现了一种特定的人类肠道细菌，它能分解美拉德反应产物Fructoselysine，并将其转化为无害的副产品。

“Fructoselysine在加工食品中很常见，包括超巴氏灭菌牛奶、意大利面、巧克力和谷物。血液中大量的Fructoselysine及类似化学物质与衰老相关，如糖尿病和动脉粥样硬化”，戈登实验室的博士后研究员、本文第一作者Ashley R. Wolf博士说。

该研究揭示了人类肠道微生物是如何分解加工食品的——尤其是在现代食品制造过程中经常产生的潜在有害化学变化；并提出了一种可能性，即利用肠道微生物组的这些知识来帮助开发更健康、更有营养的加工食品是可行的。

“从这项初步研究中获得的新工具和知识，可以用于开发更健康、更有营养的食物，以及设计潜在的策略来识别和利用某些类型的肠道细菌，这些细菌会将潜在的有害化学物质加工成无害的化学物质。一个必然的结果是，它们可以帮助我们区分哪些消费者的肠道菌群容易受到食品加工过程中某些产品的影响，或者对这些影响有抵抗力”。这表明，识别肠道微生物对潜在有害的加工食品成分的反应和降解对食品科学、微生物学和公共卫生有巨大意义。

12 Nature子刊：黏液如何驯化微生物？麻省科学家挖掘出疾病治疗新金矿，或将影响抗生素耐药及黏液缺陷等疾病的治疗

研究名称：Mucin glycans attenuate the virulence of Pseudomonas aeruginosa in infection

期刊：Nature Microbiology

发表时间：2019年10月14日

IF：14.3

DOI: 10.1038/s41564-019-0581-8

10月14日，来自麻省理工学院的一项新研究表明，在人体的眼睛、肺、胃肠道和泌尿生殖道等部位的黏液包含着数百种黏蛋白聚糖（Mucin glycans）；这些分子可以直接干扰细菌行为，如不再产生毒素、不再附着或杀死宿主细胞，甚至都不再表达细菌交流所必需的基因等；阻止细菌彼此交流，形成传染性生物膜，最终使得细菌变得无害。

此外，黏液还能与包括链球菌和真菌白色念珠菌在内的其他病原体间的相互作用，甚至能阻止微生物耐药基因的传播，且与细菌的运动和聚集无关。

这也意味着，除了过去我们所知的润滑以及物理屏障的作用；黏液的保护作用要更多、更全面。这一发现，对于人类疾病的治疗来说，无疑是“一座金矿”。

点图复习

13 Nature Communications：哈佛大学创造全新工具，可精准记录肠道菌群在各个时期的动态变化

研究名称：Bacterial variability in the mammalian gut captured by a single-cell synthetic oscillator期刊：Nature Communications发表时间：2019年10月11日IF：11.878doi:10.1038/s41467-019-12638-z

近年来，有关人类微生物的研究受到了广泛关注，但相关研究都曾面临一个共同的难题，即现有技术水平还难以观察到完整的微生物动态变化，也很难精准的获取它们是如何随时间推移对各种刺激作出各种反应的。

为了解决这一难题，来自哈佛大学威斯生物工程研究所和哈佛医学院的研究人员创造了一种新的研究工具。这种工具能够在单细胞精度水平来检测和记录小鼠体内不同细菌在各个时期的生长变化，为基于合成生物学的肠道疾病的诊断和治疗提供了一个更加详尽的信息。

这一结果也登上了当日的《Nature Communications》。

由单细胞合成振荡器捕获的哺乳动物肠道内的细菌变异

该工具使用了一种被称为抑制震荡子（repressilator）的人工合成的基因调控器，来作为监测细菌的生长的“时钟”。这种抑制震荡子由三种细菌组成，能够编码tetR、cl、lacI三种蛋白质；每种基因都能阻止另一种蛋白质的表达；以此形成了一个负反馈环。当其中其中一种抑制蛋白的浓度低于一定水平时，它所抑制的蛋白就会被表达出来，从而阻碍第三种蛋白的表达。 当这三个基因全部插入质粒并导入细菌时，通过记录负反馈循环的次数就可以推算出细菌的分裂次数——每次细菌分裂时，细胞质中出现的任何抑制蛋白都会被稀释，其浓度会逐渐下降，并在抑制周期中触发下一个蛋白的表达。 更重要的是，不管细菌的生长速度是快是慢，抑制因子循环在15.5代细菌后都会重复。这也使得它可以作为一个客观的时间测量，很像一个时钟或手表。 “想象一下，两个人戴着两块不同的手表，一个人手表上的秒针的移动速度是另一个人的两倍。如果你让两只手表都停了一小时，它们就不会在时间上达成一致，因为它们对时间的测量是根据秒针的移动速度而变化的”，本文第一作者David Riglar博士对此做了一个形象的类比，“相比之下，我们的抑制震荡子就像一块手表，总是以同样的速度移动，所以不管有多少人戴着它，它们都能给出一个一致的时间度量。这种特性使我们能够更精确地研究肠道细菌的行为。”

14 Cell子刊：免疫系统的基因差异塑造微生物群

研究名称：Polymorphic immune mechanisms regulate commensal repertoire

期刊：Cell Reports

发表时间：2019年10月15日

IF：7.815

DOI:10.1016/j.celrep.2019.09.010

微生物组研究人员面临的挑战之一是，将微生物从一只小鼠转移到另一只小鼠时，由于“批量效应”或“遗留效应”，很难比较实验结果——它很大程度上取决于源动物的微生物组、吃什么样的食物、住在哪里等。即使两个不同实验室的研究人员使用了具有相同基因背景的同一品种小鼠，他们在分析受试者的微生物群时也往往会得到不同的结果。

芝加哥大学科学家的最新研究表明，免疫系统的遗传差异，可决定细菌在消化系统中聚集的方式。

研究人员通过使用相同的“输入”微生物群定殖不同基因的无菌动物，来探究多态性宿主基因如何塑造肠道微生物群落。他们分析了接受微生物移植的小鼠及其后代体内产生的微生物的基因组序列，并比较不同免疫系统基因的影响。

动物有两种主要的免疫类型：先天性和适应性免疫系统。当研究这些不同的免疫机制如何影响受试小鼠的微生物群时，他们发现：

虽然适应性免疫对某些菌株的细菌有一定的影响，但总体上影响并不显著。在某些情况下，细菌甚至利用适应性免疫反应来茁壮成长。相反，他们看到的大多数差异可能归因于先天的多态性基因，或者MHC（主要组织相容性复合体）基因的不同变异。

遗传背景决定了“输入”相同微生物群后的“输出”

15 Nature子刊：新研究确定抗生素治疗后肠道菌群的个体化恢复模式，存在10个关键物种及过渡菌群

研究名称：Individualized recovery of gut microbial strains post antibiotics

期刊：npj Biofilms and Microbiomes

发表时间：2019年10月

IF：6.333

DOI:10.1038/s41522-019-0103-8

2019年10月，Nature子刊《npj Biofilms and Microbiomes》上发表的最新研究采用宏基因组测序和应变跟踪分析来确定了特定微生物菌株的个体内恢复模式。

在第一项试验中，有18名受试者接受了为期一周的单一抗生素头孢丙嗪治疗，结果有15名受试者短暂检测到新的微生物基因组变异。

在第二项研究中，则是对12名受试者采用了三种抗生素美罗培南、庆大霉素和万古霉素的混合物，结果所有受试者都出现了永久性或短暂的菌株变化。

总的来说，10个最丰富物种的菌株在对照组中保持稳定，分别来自Alistipes、Bacteroides、Eubacterium、Faecalibacterium、Parabacteroides几个菌属；而在单一抗生素治疗个体中，18个个体中有15个在治疗后出现了短暂的“过渡菌株”，这些菌株会在治疗后3个月被原菌株替换。

相比之下，使用三种抗生素的患者在治疗后持续六个月表现出新菌株显著增加。此外，在接受多个抗生素的个体中，这种“过渡菌株”的比例也显著升高。

这些研究结果表明，在使用抗生素破坏人类胃肠道后，存在一种个体内特异性的应变恢复模式。“从我们的分析中可以看出，从过渡菌株中恢复数量和稳定性的能力是因人而异的。不同的恢复情况可能对健康产生影响。比如随着个体年龄的增长，抗生素治疗的数量和周期可能会有所不同，某些微生物菌株可能消失，从而导致特定微生物菌株的个体内恢复模式”，该研究小组的负责Casey Morrow教授补充道。

在未来，这些个体特异性恢复模式的特征也可以用来预测内源性和外源性微生物病原体的易感性。如评估某些疾病（如癌症或糖尿病）的治疗对肠道微生物群落的影响，从而为临床研究人员提供指导。

此外，还可以应用于患者的住院前和住院后，以确定哪些人的微生物群可能需要进一步管理。

第二部分：他刊独立研究精选

16 新格兰医学杂志：2019年6月耐药菌FMT死亡患者信息公布

研究名称：Drug-Resistant E. coli Bacteremia Transmitted by Fecal Microbiota Transplant

期刊：New England Journal of Medicine

发表时间：2019年10月30日

IF：70.67

DOI:10.1056/NEJMoa1910437

不知你是否还记得，今年6月份FDA就接受粪菌移植的患者发生严重耐药菌感染而死亡发布警告的事情。

点图回顾

点图回顾《1名接受FMT的患者死亡，FDA发文警告粪菌移植风险》

10月30日，马萨诸塞州总医院于《新英格兰医学杂志》上详细公布了这2例患者的情况。根据细菌的基因检测结果，已确定供体粪便为患者感染源。这项研究，是与FMT胶囊耐药菌转移直接相关的患者死亡事件。它提示各位研究者，严格的捐赠者筛查是预防患者感染的重要手段，尤其对于那些免疫功能受损的患者。

纽约大学医学院微生物学教授、《消失的微生物》作者Martin J. Blaser于在同期配评中写道：

“两位患者有严重的潜在疾病，一位是肝硬化合并肝性脑病，另一位是造血细胞移植治疗的血液异常增生。这两名患者同时使用和以前使用的抗生素，对肠腔细菌具有广泛的对抗性，削弱了原本可以对抗病原体的微生物群。

到目前为止，FMT的并发症并不常见。对于复发性艰难梭菌感染，FMT的益处明显大于风险；然而，随着FMT使用范围的扩大，并发症可能会更频繁地出现。因此，临床试验必须精心设计，仔细权衡益处和风险以确定适应症。

短期内，我们应该针对FMT进行改进和统一的筛选（包括细菌、真菌、原生动物、病毒、细胞因子和代谢物），科学家必须确定哪一种物质是有益的，以降低FMT的风险。

另外，还应该考虑如何改进供体和宿主的匹配，包括单独给予某种活性成分。一个重要的方向是——开发有针对性的益生菌/元组合，但也应考虑包括噬菌体在内的替代方案。对于复发性艰难梭菌感染的治疗，还应开发针对艰难梭菌的窄谱药物。”

17 鸡肉不背锅，《柳叶刀》子刊：最危险的超级细菌传播点，是医院的厕所

研究名称：Extended-spectrum β-lactamase-producing Escherichia coli in human-derived and foodchain-derived samples from England, Wales, and Scotland: an epidemiological surveillance and typing study

期刊：The Lancet Infectious Diseases

发表时间：2019年10月22日

IF：27.516

DOI:10.1016/S1473-3099(19)30273-7

“在医院和社区，一种名为ESBL-E. coli的超级耐药菌正爆发式增长。它每年在英国造成超5000例菌血症，感染死亡率是普通菌株的2倍。

我们在人粪、污水、鸡肉、少数猪牛肉样本中都检测到了ESBL-E. coli，但菌株在动物和人类之间几乎没有交叉。这说明，造成人类感染的耐药大肠杆菌菌株，并非来自于食物链。

听起来可能令人不适，但数据表明，致病耐药大肠杆菌最主要的传播路径是：由人直接到人，从一个人的粪便颗粒到另一个人的嘴里。

我们再次强调厕后彻底洗手的重要性。尤其是在医院、养老院等机构，因为大多严重大肠杆菌感染发生在老年人中。”

点图回顾

在与人类和动物相关的标本类型中，大肠杆菌菌株和ESBL类型占主导地位。内环显示ESBL大肠杆菌的来源；中环代表每个ST的分离株数量与每个ESBL的关系；外圈表示ESBL型分离株的数量。

18 Gastroenterology 封面：双歧杆菌可预防和治疗阿司匹林引起的溃疡

研究名称：Bifidobacterium breve Bif195 Protects Against Small-Intestinal Damage Caused by Acetylsalicylic Acid in Healthy Volunteers

期刊：Gastroenterology

发表时间：2019年10月9日

IF：19.233

DOI: 10.1053/j.gastro.2019.05.008

近期，《Gastroenterology》以封面文章的形式刊载了一项史无前例的研究结果，即双歧杆菌可预防和治疗阿司匹林引起的溃疡。

此前，该团队曾在另一项研究中已经证实，某些双歧杆菌会产生一种保护蛋白，促进肠上皮衬里的愈合。

“虽然之前的研究已经描述了阿司匹林和非甾体抗炎药对胃的损害，但就我们所知，这是第一次详细记录阿司匹林导致小肠损害的时间过程的试验。更令人印象深刻的是，随后双歧杆菌逆转了这种破坏，因此可以作为长期服用阿司匹林的患者饮食中的天然补充”，Martin Buckley博士指出。

该研究对75名每天服用阿司匹林（300mg）的健康志愿者进行了为期6周的单点、双盲、平行组概念验证分析。参与者被随机分配为两组，一组每天口服≥5 × 10¹⁰ 的双歧杆菌胶囊（Bif195），一组每天服用安慰剂组，持续8周。

随后，研究人员在在6次随访时通过连续VCE分析记录了小肠损伤情况。肠道损伤曲线下面积(AUC) (Lewis评分)和溃疡的AUC值分别是试验的主要和第一级次要终点。

最终的疗效数据来自于服用Bif195的35名参与者和服用安慰剂的31名参与者。结果显示，Bif195组肠道损伤要明显低于安慰剂组。Bif195组报告了12例不良事件，安慰剂组报告了20例不良事件；所有这些事件都与Bif195的摄入量无关。

19 胃肠病学：西式饮食易致肠癌复发，调理肠菌可降低风险

研究名称：Western Diet Promotes Intestinal Colonization by Collagenolytic Microbes and Promotes Tumor Formation Following Colorectal Surgery

期刊：Gastroenterology

发表时间：2019年10月23日

IF：19.233

DOI:10.1053/j.gastro.2019.10.020

由于技术进步和治疗方案改善，结直肠癌患者的预后已经进步了不少。但是，即使进行完全的病理切除，许多患者仍存在肿瘤局部转移或远端转移的情况，其潜在机制仍不明确。

其中，西式饮食（高脂、无纤维、矿物质和维生素减少）是结直肠癌复发一个已知的因素。

一支芝加哥大学等机构的研究小组近日于《Gastroenterology》发文，他们研究了西式饮食促进结直肠癌切除小鼠肿瘤复发的机制，并尤其观察了小鼠微生物组分的变化。

他们发现，给小鼠食用西式饮食和使用抗生素，可以促进结直肠癌术后吻合口处的肿瘤复发，复发比例高达88%；

而同等条件下食用标准餐的小鼠，复发率则降至30%。

科学家们进一步发现，结肠肿瘤的形成与溶胶原酶和Proteus mirabilis菌的存在有关。抗生素的使用虽然消灭了溶胶原酶和Proteus mirabilis菌，但也促进了胶原酶产生菌假丝酵母菌Candida parapsilosis的出现。

但是，当科学家不给小鼠使用抗生素，而是服用Pi-PEG（它抑制细菌产生胶原酶，但不抑制细菌生长），则能减少肿瘤的形成，并维持结肠微生物的多样性。

这说明，预防特定微生物群的出现或使用酶活性策略，可用于降低结直肠癌手术患者肿瘤复发的风险。

20 首次发现：阳光暴露会改变人类肠道菌群

研究名称：Skin Exposure to Narrow BandUltraviolet (UVB) Light Modulates the Human Intestinal Microbiome

期刊：Frontiers in Microbiology

发表时间：2019年10月24日

IF：10.259

DOI:10.3389/fmicb.2019.02410

10月24日，《Frontiers in Microbiology》上刊载了第一项表明皮肤暴露于UVB光下，会引起人体肠道微生物群改变的研究。在整个调节中起到关键作用的成分，正是我们熟悉的维生素D。

此前，有关维生素D会引起肠道微生物群的变化，仅在啮齿动物身上出现过。

而在这项新的临床试点研究中，研究人员测试了皮肤暴露于UVB对人体肠道微生物群的影响。共有21名健康的女性志愿者在一周内接受三次一分钟的全身UVB暴露。并在治疗前和治疗后，取粪便样本进行肠道细菌分析——以及血液样本进行维生素D水平分析（编者按：暴露在阳光下的UVB可以促进皮肤产生维生素D）。

结果显示，UVB光照射后，维生素D水平升高，Lachnospiracheae、Rikenellaceae、Desulfobacteraceae、Clostridiales vadinBB60 group、Clostridia Family XIII、Coriobacteriaceae、Marinifilaceae、Ruminococcus都出现了富集；尤其是毛螺菌科（Lachnospiraceae）中的Lachnopsira和Fusicatenibacter genera与血清中的维生素D水平显著相关。

阳光暴露前后的微生物组分析

“接触UVB可能会在一开始改变皮肤的免疫系统，然后免疫系统地改变，又会反过来影响肠道环境对不同细菌的适应程度。”

这一发现，对正在接受UVB光疗的人有十分重要的意义，并提示了“皮肤-肠道轴”的存在；或有助于解释UVB光在多发性硬化（MS）和炎症性肠病（IBD）等炎症性疾病中的保护作用。

21 环境抗生素毁肠菌：美国科学家发现环境中低浓度抗生素可致肠道细菌结构改变、数量千倍级骤减，或参与耐药性加速扩散

研究名称：Sublethal antibiotics collapse gut bacterial populations by enhancing aggregation and expulsion

期刊：Proceedings of the National Academy of Sciences

发表时间：2019年10月

IF：9.58

DOI:10.1073/pnas.190756711

抗生素滥用已经成为人类健康最大威胁之一。

在各种来源的抗生素中，最容易被忽视的就是环境中抗生素；它的来源可能是生活污水、医疗废水，甚至是动物饲料和水产养殖废水排放等。

这些随着我们的饮用水、食物进入人体的抗生素，虽然浓度不高，同样危害巨大。

近期，刊登于《美国国家科学院院刊》上一项最新研究指出，环境中发现的低浓度抗生素还可能对肠道细菌产生重大影响，包括肠道细菌群落的结构变化、细菌种群数量严重下降等；其中，肠杆菌数量甚至下降了1000倍。

该研究提供了一个能够预测菌落大小的变化肠道细菌动态的数学模型，并为评估人类和其他动物的抗生素干扰提供了一个重要框架。

点图回顾

低浓度抗生素环丙沙星诱导了弧菌聚集和从体内排出。A图为实验时间轴示意图；F图为未处理（上）和环丙沙星处理后（下）弧菌种群的三维图像的最大强度投影及由肠道排出的细菌的活性染色图，绿色和洋红色分别表示活细胞和死细胞

22 临床癌症研究：肠菌预测放疗副作用

研究名称：Microbiota- and Radiotherapy-Induced Gastrointestinal Side-Effects (MARS) Study: A Large Pilot Study of the Microbiome in Acute and Late-Radiation Enteropathy

期刊：Clinical Cancer Research

发表时间：2019年10月1日

IF：8.911

DOI:10.1158/1078-0432.CCR-19-0960

放疗是治疗盆腔癌的重要手段，但它可能引发的一个副作用是剂量相关的放射性肠病。这种副作用往往会持续很长时间，而且相当严重。

在这项迄今为止最大的、探讨微生物群与急性、晚期放射性肠病的关系的临床研究中，伦敦癌症研究所和伦敦帝国理工学院的一个研究小组，分析了134名患者在前列腺和盆腔淋巴结放疗前后不同阶段的粪便/结肠黏膜样本。

研究人员发现，肠道损伤风险高的患者的三种细菌水平高出30-50%（分别是Clostridium IV, Roseburia, Phascolarctobacterium），肠道微生物群的总体多样性也较低。

这表明，肠道菌群多样性较低、上述三种细菌水平较高的患者更容易遭受放射性肠病。

研究人员表示，“我们的研究首次表明，肠道细菌对患者放疗后胃肠道副作用的易感程度有重要影响。我们仍需要做进一步研究，来确认好细菌的作用，以及尝试通过肠道菌群识别出高副作用风险的患者，进行粪便移植等微生物疗法，或通过改变辐射剂量，来治疗或预防他们的肠道损伤”。

粪便微生物群相关分析。粪便和直肠粘膜肠道菌群与直肠细胞因子水平相关，乙状结肠菌群与直肠细胞因子水平相关

23 JAMA Dermatology：新方法用胶带可检测儿童湿疹和特应性皮炎

研究名称：Use of Tape Strips to Detect Immune and Barrier Abnormalities in the Skin of Children With Early-Onset Atopic Dermatitis

期刊：JAMA Dermatol

发表时间：2019年10月9日

IF：7.995

doi:10.1001/jamadermatol.2019.2983

10月10日，《JAMA Dermatology》报道了首个在皮损和非损伤性皮肤上使用微创胶带，来获取儿童特应性皮炎的免疫和表皮屏障生物标志物，用于跟踪早发型儿童湿疹或婴幼儿特应性皮炎（AD）的严重程度的非侵入性的方法。

该研究由西奈山伊坎医学院和西北大学Feinberg医学院共同完成。根据研究结果，在相同的皮肤区域多次使用胶带，为区分早发性AD皮肤和正常儿童皮肤提供了一个完美的分类器，包括与AD相关的生物标志物。

“这项研究能够非侵入性地收集儿童皮肤，以便更好地了解各种皮肤疾病，并开始在前瞻性研究中识别预测病程、共病和治疗反应的标志物；对于婴儿和儿童的纵向研究以及儿童和成人的临床试验都具有很高的参考价值”。而此前，在儿科纵向研究或临床试验中，一直缺乏一种可重复的微创方法来跟踪皮肤疾病。广泛用于评估皮肤特应性皮炎表型的皮肤活检也并不总是适用于儿童。

此外，同样的胶带条也可以用于收集和分析皮肤微生物群落（包括皮肤表面的细菌和病毒），允许调查比较皮肤微生物种群的变化和基因/蛋白质的变化。

24 流行病学数据：中国每年约1.36万婴儿感染B族链球菌，死亡率2.3%

研究名称：Clinical and Molecular Epidemiology of Invasive Group B Streptococcus Disease among Infants, China

期刊：Emerging Infectious Diseases

IF：7.185

DOI:10.3201/eid2511.181647

侵袭性B组链球菌（GBS）是一种革兰氏阳性无乳链球菌，GBS感染仍然是全球婴儿（包括高收入国家在内）疾病和死亡的主要原因。

最近，上海交大、西安交大等团队对中国16个省的18家定点医院进行了一项多中心人群研究，目的是确定我国3个月以下婴幼儿GBS感染的流行病学特征，并通过血清分型和多位点序列分型对感染菌株的分子流行病学进行评价。

研究发现，中国每年约有13604例婴幼儿的GBS感染，且在中南部地区的流行率较高。感染导致了1142例GBS相关的死亡，病死率为2.3%。

调查数据显示，B族链球菌对头孢菌素、氨苄西林、万古霉素、美罗培南和利奈唑胺100%敏感。但研究人员观察到，部分患者对四环素（80.1%）、红霉素（78.3%）和克林霉素（68.2%）敏感性降低。

与其他国家类似，97%的侵袭性GBS血清型分布在Ia, Ib, II, III, V型。目前我国的五价和六价GBS疫苗将覆盖上述所有血清型。

研究强调了孕产妇接种GBS疫苗，以预防新生儿侵袭性B组链球菌感染的疾病预防策略。

按省份划分的3个月以下婴儿侵袭性B组链球菌病发病率

25 台湾科学家发现，一种益生菌菌株可改善小鼠睡眠

研究名称：Hypnotic Effects of Lactobacillus fermentum PS150TM on Pentobarbital-Induced Sleep in Mice

期刊：Nutrients

发表时间：2019年10月9日

IF：4.171

DOI:10.3390/nu11102409

睡眠与胃肠健康之间存在动态的双向关系。通过“微生物-肠-脑轴”，肠道微生物群不仅影响消化、免疫和代谢功能，还影响着宿主的睡眠和精神状态。

既往的研究已经发现，一些益生菌可通过靶向“微生物-肠-脑轴”改善睡眠。在本次实验中，台湾阳明大学团队首先筛选了不同的乳酸菌属菌株。随后他们发现，一种特殊的发酵乳杆菌菌株PS150TM具有改善睡眠的作用。

已有一些报告称，该菌株在应激状态下可改变小鼠5-羟色胺通路。于是他们利用小鼠模型，进一步发现：

单独口服发酵乳杆菌PS150TM菌株，显著缩短了小鼠的睡眠潜伏期，并延长了小鼠的睡眠时间。该菌株可以在不影响小鼠活动的情况下，为正常和咖啡因治疗（模拟短期失眠）的小鼠带来潜在的睡眠改善效果。

这为未来开发包括益生菌在内的、安全性更高的助眠剂指明了新方向。

口服L. fermentum菌株对小鼠的影响

26 睡眠浅、易惊醒、反应慢，可能是肠道菌的锅，首次证实菌群-睡眠-免疫-认知存在关联

研究名称：Gut microbiome diversity is associated with sleep physiology in humans

期刊：PLOS ONE

发表时间：2019年10月

IF：2.776

DOI:10.1371/journal.pone.022239

根据近期《PLOS ONE》刊载的一篇最新研究，改善肠道菌或许能让我们收获长期的高质量睡眠。

简单来说，根据该研究，微生物的总体多样性与睡眠效率、总睡眠时间以及白细胞介素-6（IL-6）呈正相关，与入睡后的苏醒呈负相关；包括Lachnospiraceae、Corynebacterium、Blautia在内的几种微生物与睡眠质量呈负相关；不良睡眠则会直接对肠道菌群产生负面影响。

这一研究结果首次确立了肠道微生物组组成、睡眠生理学、免疫系统和认知之间的联系；为未来通过肠道微生物来改善睡眠奠定了基础。

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第三部分：高分综述、标准·指南·共识

27 Nature子刊资深编辑：“吃什么决定了你的微生物组”

研究名称：Your microbiome is what you eat

期刊：Nature Reviews Microbiology

发表时间：2019年10月17日

IF：34.648

DOI:10.1038/s41579-019-0287-1

10月17日，《Nature Reviews Microbiology》的资深编辑Ashley York发文汇总了近期3篇饮食-微生物组研究的亮点。

1.Zaramela，Martino和Alisson-Silva 等人研究了肠道微生物群对富含N-糖基神经氨酸（Neu5Gc）的饮食的反应。

Neu5Gc是一种来源于红肉的唾液酸，被认为可促进炎症和肿瘤发生。作者比较了缺乏Cmah（一种合成Neu5Gc的酶）的小鼠在无唾液酸饮食，以及富含Neu5Gc饮食中的肠道微生物群。

他们发现，富含Neu5Gc的饮食会引起微生物群的变化，其中Bacteroidales 和Clostridiales菌的增加最为明显。

随后，他们还在小鼠和人类的微生物组中，鉴定出了偏好Neu5Gc的唾液酸酶，并证实了小鼠和人类的细菌唾液酸酶可从红肉中释放出Neu5Gc，从而具有减少炎症的潜在作用。

2.Ivey等人研究了类黄酮对人体肠道微生物组分的影响。

黄酮类化合物是一类多酚类植物代谢产物，具有改善血压等益处。已知肠道微生物群会影响宿主体内类黄酮的活性和生物利用度，但经常摄入类黄酮对微生物群的影响尚不清楚。

研究人员对240多名健康成年男性的评估结果显示，6个类黄酮亚类与特定的微生物群落模式有关。例如：

Eggerthella lenta与黄酮醇和黄烷酮的消耗量有关；

Adlercreutzia equalifaciens的丰度与黄酮醇和黄烷醇单体的消耗量有关。

3.Carmody等人研究了烹饪方式如何影响肠道菌群。

他们发现，食用生/熟肉的小鼠肠道菌群差异不大，但生/熟植物性饮食则使小鼠肠道微生物结构和功能发生了变化：生食小鼠肠道菌群中淀粉、糖和外源物质代谢基因表达较高，淀粉消化率是导致肠道菌群中许多烹饪相关变化的驱动因素。

与烹饪相关的微生物群的变化调节了宿主的能量状态，而且这种变化在人类中也存在。

这些研究共同强调了饮食对肠道微生物群的可塑性。从机制研究中，我们可以摸索以肠道菌群为靶标的个性化营养方法。

28 港中文团队发Nature Reviews：结直肠癌中的肠道菌群（从机制到临床）

研究名称：Gut microbiota in colorectal cancer: mechanisms of action and clinical applications

期刊：Nature reviews Gastroenterology & Hepatology

发表时间：2019年9月25日

IF：23.57

DOI:10.1038/s41575-019-0209-8

近日，香港中文大学黄曦、于君教授于《Nature Reviews》发表综述文章，总结了目前在结直肠癌（CRC）领域中相关的肠道菌群研究进展。

这篇文章涵盖的内容包括：

微生物的致癌机制；利用肠道菌群（尤其是具核梭杆菌Fusobacterium nucleatum）作为CRC生物标志物的潜力；以及利用肠道菌群防治CRC的前景。

本综述特别强调了那些可能未来将在临床上应用的、与临床转化相关的机制研究。

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作者黄曦（左）和于君（右）教授，图源：香港中文大学

29 Gut：亚太胃肠病学协会（APAGE）和亚太消化内镜学会（APSDE）确定粪菌移植研究和实践的关键要素

研究名称：Scientific frontiers in faecal microbiota transplantation: joint document of Asia-Pacific Association of Gastroenterology (APAGE) and Asia-Pacific Society for Digestive Endoscopy (APSDE)

期刊：Gut

发表时间：2019年10月

IF：17.943

DOI:10.1136/gutjnl-2019-319407

2019年10月14日，《Gut》上一则最新研究探讨了粪便微生物移植的潜在微生物基础、治疗效果的预测因素和有效成分。

在香港举行的会议上，包括香港中文大学黄秀娟、广州市第一人民医院周永健、南京医科大学第二附属医院张发明在内的亚太地区16名专家，通过文献评估和圆桌讨论的形式，就以下5个问题进行了讨论：

供体和受体微生物（细菌、病毒、真菌）组成在FMT中的作用；

评估微生物群变化的方法；

FMT的关键物种和微生物预测因子的概念；

受体概况和抗生素预处理对FMT的移植和维持的影响；

FMT制剂和给药的新进展。

粪菌微生物移植的潜在机制

该专家小组认为，

FMT的不同结果与受体微生物群的组成和功能差异有关，也可能与供体相关和受体相关的生理和遗传因素有关。

供体肠道菌群的组成可能影响FMT治疗复发性艰难梭菌感染和溃疡性结肠炎的疗效。

FMT粪悬液需新鲜、冷冻或冻干，考虑菌的耐氧情况，可通过传统/内镜方式（如TET）或口服胶囊给药，注意频率和剂量。

FMT不仅能改变细菌的组成，还能在肠道真菌、病毒和细菌之间建立跨界平衡，促进微生物稳态的恢复。

FMT不是一种放之四海而皆准的方法，需要针对不同疾病的选择特定菌群。

粪便微生物菌群移植FMT给药：下消化道给药可以通过灌肠或结肠镜检查，上消化道给药则通过胃镜检查或鼻肠管输液来完成

30 湖南湘雅医院发nature子刊综述：肠道菌如何参与宿主免疫和代谢

研究名称：Demystifying the manipulation of host immunity, metabolism, and extraintestinal tumors by the gut microbiome

期刊：Signal Transduction and Targeted Therapy

发表时间：2019年10月12日

IF：5.873

DOI:10.1038/s41392-019-0074-5

由肠道微生物群、免疫和系统代谢组成的动态功能网络，对实现和维持宿主的健康和动态平衡具有非常重要的意义。

胃肠道提供一个有利于微生物定植的自然厌氧环境，肠道微生物组反过来对宿主生理产生重要影响，包括：控制宿主蛋白质组的翻译后修饰；刺激免疫系统发育和内环境稳定；保持肠道屏障完整；从饮食中获取难以获取的营养素；合成某些必需的维生素和神经递质；调节神经行为特性、内分泌功能和骨密度，甚至参与药物生物转化。

在这篇综述中，湖南湘雅医院团队总结了肠道菌群参与宿主免疫和代谢的最新证据，肠道菌群对肠外肿瘤（肝癌、乳腺癌、胰腺癌、黑色素瘤）和免疫反应的影响，以及调节肠道菌群的策略，包括基于微生物的、有望成为新的癌症治疗策略的干预手段，并讨论了正在进行的研究和未来值得重点关注的领域。

肠道微生物及其代谢产物影响肝癌发生发展的潜在机制

第四部分：产业研究

31 几家欢喜几家愁，百亿微生态药物产业的沉与浮

此前，我们曾分析药企巨头入局微生态，试图通过与微生态初创企业的结合，从微生态角度抢占肿瘤免疫疗法的下一轮先机。还介绍过粪菌银行在微生态药企的压力下举步维艰，运营困难，很可能被活体生物药替代，根本没有未来。

这无一都预示着：药物，已是微生态最具价值的发展方向之一。

据不完全统计，全球范围内超过30家微生态药企融资超过19亿美金。其中，2019年就有近10亿美元砸向了Finch Therapeutics、Vedanta Biosciences、Azitra、Biomx、DayTwo等公司。

截止目前，微生态药物有上百个管线在研发，但仍无一成功。以Finch Therapeutics、Seres Therapeutics、Vedanta Biosciences为代表的微生态药物创业明星尽管在资本层面融资不断，但行业里接连失败的管线以及不确定的未来、高昂的科研投入，已经给行业蒙上了一层不确定的色彩。

目前，微生态药物主要有活体生物药、微生态小分子制剂、大分子药、噬菌体四大类，适应症涵盖免疫性疾病、代谢性疾病、神经系统疾病、感染性疾病及肿瘤等领域，主要有感染、炎症、糖尿病、肿瘤等。

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各适应症微生态药企布局情况（知几未来研究院）

第五部分：知几·特别企划

32 走进冷冻室的娱乐明星|人类的胖菌第③篇

这是一种近年来流行于运动选手、保健员中的理疗方法。并非说笑，它有自己的专业名词：超低温冷疗（cryotherapy）。

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实际上，使用低温刺激塑形和治疗伤病的方法并不新鲜。

2016年，通过局部冷却减少脂肪层厚度的“冷冻溶脂”法，几乎占据美国塑形治疗总市场的一半；冰敷可降低组织温度和神经传导速度、收缩血管，是常见急性扭伤的首要应对措施；医生也会使用局部冷疗，对付疣或癌症。

然而，抛开各类冷疗手段，温度骤降本身就与减重存在一定联系。一直以来，科学家们就发现，短期的冷暴露会导致能量摄入相关的消耗增加，并抑制体重和白色脂肪量。

直到最近几十年，人们才知道这不仅仅是能量短缺环境下，机体产热的增加导致。冷暴露不仅改变了肠道中细菌的组成，还能激活帮助人类减肥的“棕色脂肪“。

在肥胖系列第3篇中，我们重点关注的是：在微生物层面，肠道菌群是如何参与这一切的。

33 22种癌症相关消化道菌群：筛查、诊断和预后标志物

在生物医药界，肠道微生物群是癌症治疗革命的后起之秀。

就在过去5年中，“Oncomicrobiome”（肿瘤菌群）一词开始用来指代这一炙手可热的研究课题。科学家们正逐渐接受这一事实：生活在人类消化道中、数以万亿计的细菌、真菌、病毒等微生物，也许是一个免疫肿瘤学的新靶点，具备为癌症患者开发新疗法的潜力。

事实上，各大顶级医学期刊所发表的小鼠和人类实验报告，已经初步揭示了肠道菌群在癌症中的作用。

比如，肠道菌群帮助对抗肿瘤。其中，最惊喜的一些发现，来自肠道菌群作为“癌症筛查、诊断和预后标志物”的潜力。

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2、pda医学上是什么意思：pda是什么

简要回答

Pda其实就是掌上电脑，平时人们所用的智能手机，笔记本电脑都属于PDA的范畴，Pda的应用范围还是很广的。

不少人经常会在电脑科普杂志上看到PDA这个概念，究竟这个PDA是什么意思呢？它都有什么特点和应用范围有哪些？下面让我们一起去了解吧。

详细内容

可以帮助人们完成在移动中工作、学习、娱乐等。按使用来分类，可分为工业级PDA和消费品PDA。工业级PDA主要应用在工业领域，常见的有条码扫描器、RFID读写器、POS机等都可以称作PDA；消费品PDA包括的比较多，智能手机、平板电脑、手持游戏机等。

工业级PDA具有数据存储及计算能力，有显示和输入功能，能与其他设备进行数据通讯，有独立电池供电，可进行二次开发。其特点是坚固、耐用，可以用在很多环境比较恶劣的地方，同时针对工业使用特点做了很多的优化。

PDA(Personal Digital Assistant)，是个人数字助手的意思。顾名思义就是辅助个人工作的数字工具，主要提供记事、通讯录、名片交换及行程安排等功能。

掌上电脑最大的特点是具有开放式的操作系统，支持软硬件升级，集信息的输入、存储、管理和传递于一体，具备常用的办公、娱乐、移动通信等强大功能。因此，PDA完全可以称作一个移动办公室。

国内大部分掌上电脑都是使用Win CE系统，包括国内的联想、方正以及国外的HP、COMPAQ等公司都有Windows CE掌上电脑推出。作为两大操作系统，采用PalmOS的产品电池使用时间比采用Win CE的产品长；配置彩色显示屏的产品没有单色显示屏产品的电池使用时间长；在多媒体性能上，Win CE要比Palm好一些；而且操作界面与应用性能上，wince可以让用户更易上手；另外，在软件的数量上，Palm要比Win CE多一些 。

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