普洱茶的地理价值源于云南特定的地理系统。
这一特定的地理系统包括自然地理、气候和生态多样性的整合所创造的自然生态和物种多样性。云南低纬度、高海拔的地理特点，加上热带雨林的季风气候，使其形成了一个庞大的自然生态循环系统，造就了云南特有的生态系统多样性和物种多样性。
云南的生态系统多样性包括陆地生态系统和水生生态系统。
它的陆地生态系统几乎包括了地球上所有的生态系统类型。其中，森林生态系统以树木为标志，主要有169种，占中国的80%。灌丛生态系统有四种类型：冷温灌丛、暖石灰岩灌丛、干热河谷灌丛和热漫滩灌丛。云南草甸类型分布广泛，主要分为高寒草甸、沼泽化草甸和冷暖草甸三种生态系统类型。
其水生生态系统包括河流生态系统和湖泊生态系统。云南的六大水系，即金沙江、澜沧江、怒江、伊洛瓦底江、元江、南盘江，构成了云南淡水生态系统的基本框架。滇池、洱海、抚仙湖、异龙湖、泸沽湖等云南高原湖泊反映了我国淡水生态系统的一些特殊性。根据生活型，云南水生植被可分为挺水植物、浮叶植物、沉水植物和漂浮植物四种类型。在水生动物方面，浮游动物、底栖生物和鱼类资源丰富。
云南的物种多样性世界罕见。云南不仅有动物界、植物界之称，还有竹林之乡、药林宝库、天然花园、菌类世界等美誉。云南有竹类资源28属220种，分别占全国的75%和55%，世界的40%和25%。药材、花卉、香料、菌类种类居全国首位。
云南从北到南，从高海拔到低海拔，有从高山针叶林到热带雨林等105个主要森林类型。森林类型的数量在中国也是罕见的。因此，云南堪称世界生物标本库，
普洱茶就是在这样一个大的自然生态系统中诞生的。当云南古人将这一体系中的一种或几种物质融入普洱茶时，普洱茶的物质组合就不仅仅是几片茶叶的叠加，而是地理特征和自然生态的另一种表达。其中，一些参与普洱茶发酵的微生物菌群已经繁衍了上亿年。所以，一片普洱茶不仅是商品，更是地域价值的再生产。